Малокарачаевский район основан в 1922 году.
К началу XX века территория нынешнего Малокарачаевского района входила в состав Баталпашинского отдела Кубанской области (аул Кумско-Лоовский), Нальчикского округа (селение Хасаутское) и Пятигорского отдела (селение Старо-Абуковское) Терской области.
Малокарачаевский район был впервые образован в 1922 году как Мало-Карачаевский округ вновь образованной Карачаево-Черкесской автономной области.
30 сентября 1931 года Малокарачаевский округ был преобразован в Малокарачаевский район.
12 октября 1943 года Карачаевская автономная область была упразднена и Малокарачаевский район был передан в подчинение Ставропольскому краю.
6 ноября Малокарачаевский район был переименован в Кисловодский.
В 1957 году, после повторного образования Карачаево-Черкесской автономной области и повторного образования в её составе Малокарачаевского района, центр района переместился в село Учкекен.
1 февраля 1963 года был образован Малокарачаевский сельский район с центром в селе Учкекен.
12 января 1965 года Президиумом Верховного Совета РСФСР Малокарачаевский сельский район Карачаево-Черкесской автономной области преобразован в район.
Численность постоянного населения Малокарачаевского района 42 803 человек.
Общая численность занятых в экономике составляет 22.300 человек.
Общее число индивидуальных предпринимателей 1.220 человек, в том числе 280 глав КФХ. Количество юридических лиц составляет 486 единиц, из них к субъектам малого и среднего предпринимательства относится 338 предприятий.
Общая площадь сельскохозяйственных угодий в районе около 96 тыс. га. На территории района расположен ООО Госплемзавод «Карачаевский», племрепродуктор ООО «Меркурий», племрепродуктор ООО «Чолпан», племрепродуктор ООО «Сатурн».
Система образования Малокарачаевского района насчитывает 34 образовательных учреждения: 10 дошкольных, 15 общеобразовательных учреждений, 2 дошкольных отделения на базе общеобразовательных школ, 7 учреждений дополнительного образования.
На территории района находится ООО “Туристическая компания “Медовые водопады”.
В 2017 году открыт музейный центр «Рум-Кала».
На территории района функционирует: ОАО «Завод Элия, РГУП «Малокарачаевское АТП», ГУП «Малокарачаевский ДРСУЧ», Узел почтовой и электросвязи.
В районе 1 центральная больница,1 участковая больница, 3 врачебные амбулаторные, 4 фельдшерско-акушерских пункта, 4 фельдшерских пункта, 2 здравпункта.
